Individuazione delle principali malattie virali della cipolla CV “rossa di Tropea” e studi sull’epidemiologia e sulla varaiabilità genetica dei relativi agenti eziologici

The survey on phytosanitary state of onion cv 'Rossa di Tropea' related to onion viral diseases showed that Onion yellow dwarf virus (OYDV) is the most important in terms of spread, severity of symptoms and damage specifically caused to the crop for seed production and that Iris yellow spot virus (IYSV), emerging for the Italian country, is present in Calabria (first report) in a rather large area without serious damage to the crops. OYDV is mainly transmitted by bulbs in seed- cultivations, while the transmission of the virus through the seed was excluded in this cultivar. Keeping the seedbeds separated from other onion cultivations very low percentage or close to zero infection was observed. IYSV disease was found in seed-crops in late spring but earlier than in bulb-cultivations, and at a great presents of thrips and for the first time the use of real time RT-PCR and nested PCR allowed to detect IYSV in the apex inside the bulbs. The study of the genetic variability showed, in the studied region (NIb-CP- 3'UTR), a homology of 85.0% between isolates found on onion (OYDV-O) and those on garlic (OYDV-G) displaying that the OYDV-O and OYDV-G isolates could be considered the same species according to the thresholds of demarcation between species in the genus Potyvirus. Further, the first event of genetic recombination between OYDV-O isolates has been established. Within the genus Tospovirus, homology analysis and phylogenetic study showed for both studied regions (NSm and Gn/Gc in RNA-M) the closeness of the group IYSV to Tomato yellow ring virus (TYRV). Within the IYSV group, Italian isolates were phylogenetically close to the isolate from USA.

: L’indagine sullo stato fitosanitario della cipolla cv ‘Rossa della Tropea’ ha evidenziato che, tra i virus riportati in cipolla, Onion yellow dwarf virus (OYDV) è risultato il virus più importante in termini di diffusione, sintomatologie e danni causati, in particolare alla coltura portaseme e che Iris yellow spot virus (IYSV), virus emergente per il territorio italiano, è presente anche in Calabria (prima segnalazione) in un areale piuttosto ampio ma senza gravi danni alle coltivazioni. Riguardo a OYDV, è emerso che i bulbi costituiscono la principale fonte di infezione nella coltura portaseme, mentre è stata esclusa la trasmissione per seme del virus in questa cultivar. La separazione dei semenzai dalle altre coltivazioni ha consentito di ottenere basse percentuali di infezione nella coltura da bulbo. Riguardo a IYSV, la malattia è stata riscontrata nelle coltivazioni portaseme in anticipo rispetto alle coltivazioni da bulbo, a primavera inoltrata e in corrispondenza di un maggior numero di tripidi. Per la prima volta, l’uso di real time RT-PCR e nested-PCR ha evidenziato la presenza di IYSV nell’apice vegetativo all’interno dei bulbi. Lo studio della variabilità genetica ha evidenziato, nella regione studiata (NIb-CP-3'UTR), una omologia dell’85,0% tra gli isolati di OYDV riscontrati su cipolla (OYDV-O) e quelli su aglio (OYDV-G), dimostrando che OYDV-O e OYDV-G possono essere considerati la stessa specie secondo le soglie di demarcazione tra specie nel genere Potyvirus. Inoltre, è stato riscontrato il primo evento di ricombinazione genica tra isolati di OYDV-O. All’interno del genere Tospovirus le analisi di omologia e lo studio filogenetico hanno mostrato per entrambe le regioni studiate (NSm e Gn/Gc del RNA-M) la vicinanza del gruppo IYSV a Tomato yellow ring virus (TYRV). All’interno del gruppo IYSV gli isolati italiani sono risultati filogeneticamente vicini all’isolato degli USA.