Aim of this work is a phylogenetic study of gen. Allium of Sect Codonoprasum, based on morphological and molecular data (nDNA and cpDNA). Main morphological data were processed by software NTSYSpc using UPGMA analysis. Molecular analysis were performed using 3 different DNA markers frequently used in angiosperm phylogeny: ITS, psbA-trnH and rbcL. 95 Allium samples collected in different Mediterranean sites were analyzed by extraction, amplification and sequencing of genetic material. DNA sequences were processed by software Paup 4.0 using criterion of maximum parsimony. The obtained phylogenetic trees were commented and compared with current classification of Allium sect. Codonoprasum. Relevant differences and new interesting phylogenetic relationships resulted from this study,
Lo scopo di questo lavoro è uno studio filogenetico delle specie di Allium appartenenti alla sez. Codonoprasum basato sulla comparazione di dati morfologici e molecolari (nrDNA e cpDNA). I principali dati morfologici sono stati analizzati tramite il software NTSYSpc usando l analisi UPGMA. Il lavoro è stato condotto analizzando 3 differenti markers genetici che normalmente vengono usati nelle analisi filogenetiche: ITS, sbA-trnH e rbcL. Sono stati analizzati 95 campioni,provenienti da diverse stazioni dell area mediterranea, attraverso estrazione, amplificazione e sequenziamenti del materiale genetico. Le sequenze geniche ottenute sono state processato tramite il software Paup 4.0 usando il criterio della massima parsimonia. Gli alberi filogenetici ottenuti sono stati commentati e comparati con le attuali classificazioni del gen. Allium sez. Codonopraum. Da questo studio emergono nuove e interessanti relazioni filogenetiche tra le specie di Allium della sez. Codonoprasum
FILOGENESI DELLE SPECIE DI ALLIUM DELLA SEZ. CODONOPRASUM
GIACALONE, GABRIELE
2011
Abstract
Aim of this work is a phylogenetic study of gen. Allium of Sect Codonoprasum, based on morphological and molecular data (nDNA and cpDNA). Main morphological data were processed by software NTSYSpc using UPGMA analysis. Molecular analysis were performed using 3 different DNA markers frequently used in angiosperm phylogeny: ITS, psbA-trnH and rbcL. 95 Allium samples collected in different Mediterranean sites were analyzed by extraction, amplification and sequencing of genetic material. DNA sequences were processed by software Paup 4.0 using criterion of maximum parsimony. The obtained phylogenetic trees were commented and compared with current classification of Allium sect. Codonoprasum. Relevant differences and new interesting phylogenetic relationships resulted from this study,File | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.14242/74195
URN:NBN:IT:UNICT-74195