Genome integrity assessment of edited CD4+ lymphocytes for the treatment of Hyper-IgM 1

Abbiamo in precedenza sviluppato una strategia di terapia genetica per la sindrome da IperIgM 1, basata sull'inserzione di una sequenza correttiva di cDNA in un taglio del doppio filamento del DNA situato all'interno del primo introne del gene CD40LG. In questo elaborato abbiamo valutato l'integrità del genoma vicino al sito di taglio, riscontrando la presenza di estese delezioni che sono contro-selezionate nel tempo. Inoltre, abbiamo utilizzato mappe ottiche per valutare l'integrità del genoma in modo imparziale.

We have previously developed a gene editing strategy for the treatment of Hyper IgM 1, based on insertion of a cDNA corrective template in a Cas9 induced genomic double strand break in the first intron of the CD40LG gene. Here we evaluate on-site genome integrity, uncovering the presence of self-purging large deletions and apply optical mapping for the unbiased assessment of genome-wide integrity.