I processi biologici che regolano le funzioni di base di una cellula sono caratterizzati da numerose interazioni tra geni. Da un punto di vista matematico, è possibile rappresentare queste interazioni attraverso grafi in cui i nodi e gli archi rappresentano, rispettivamente, i geni coinvolti e le loro interazioni. L’obiettivo principale di questa tesi è quello di sviluppare un approccio statistico alla modellazione delle interazioni tra geni quando questi sono misurati su scala discreta. Vengono a tal fine proposti vari algoritmi. La prima proposta è relativa ad un algoritmo disegnato per stimare la struttura di un grafo non orientato, per il quale si fornisce la dimostrazione di convergenza al crescere delle osservazioni. Altre tre proposte coinvolgono la definizione di algoritmi supervisionati per la stima della struttura di grafi direzionali aciclici, basati su una specificazione del modello statistico che ne garantisce l’identificabilità. Sempre con riferimento ai grafi direzionali aciclici, infine, si propone un algoritmo non supervisionato. Tutti gli algoritmi proposti mostrano risultati promettenti in termini di ricostruzione delle vere strutture quando applicati a dati simulati e dati reali.

Structure learning of graphs for count data

NGUYEN, THI KIM HUE
2018

Abstract

I processi biologici che regolano le funzioni di base di una cellula sono caratterizzati da numerose interazioni tra geni. Da un punto di vista matematico, è possibile rappresentare queste interazioni attraverso grafi in cui i nodi e gli archi rappresentano, rispettivamente, i geni coinvolti e le loro interazioni. L’obiettivo principale di questa tesi è quello di sviluppare un approccio statistico alla modellazione delle interazioni tra geni quando questi sono misurati su scala discreta. Vengono a tal fine proposti vari algoritmi. La prima proposta è relativa ad un algoritmo disegnato per stimare la struttura di un grafo non orientato, per il quale si fornisce la dimostrazione di convergenza al crescere delle osservazioni. Altre tre proposte coinvolgono la definizione di algoritmi supervisionati per la stima della struttura di grafi direzionali aciclici, basati su una specificazione del modello statistico che ne garantisce l’identificabilità. Sempre con riferimento ai grafi direzionali aciclici, infine, si propone un algoritmo non supervisionato. Tutti gli algoritmi proposti mostrano risultati promettenti in termini di ricostruzione delle vere strutture quando applicati a dati simulati e dati reali.
15-gen-2018
Inglese
Graphical models, Undirected graphs, Directed acyclic graphs, Structure learning, Sparsity, Identifiability, Consistency, Conditional independence tests, Topological ordering.
CHIOGNA, MONICA
Università degli studi di Padova
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.14242/174160
Il codice NBN di questa tesi è URN:NBN:IT:UNIPD-174160