Mining Biological Networks

In questa tesi sono stati affrontati alcuni aspetti problematici legati all’analisi di reti biologiche. Concentrandosi sull’allineamento di reti di interazione proteica, è stato studiato l’uso di metodi basati sul ”path redundancy“ per filtrare il rumore attualmente presente nei dati. In una seconda direzione di ricerca le reti di regolazione sono state sfruttate per spiegare la capacità dei ”master regulators“ di modulare il comportamento delle cellule, adattando di una pipeline d’analisi allo studio degli effetti dei miRNA nel Glioblastoma Multiforme. I progressi metodologici introdotti in questo lavoro contengono potenziali miglioramenti ad alcuni elementi comuni ad altre tecniche di analisi di reti.