Molecular and clinical Endo-phenotyping of patients affected by Chronic Kidney Diseases and Podocytopathies

Tra il 15 e il 20% dei pazienti con malattia renale allo stadio terminale (ESRD) non conosce la causa che ha condotto alla malattia renale cronica e può sviluppare complicanze dopo il trapianto di rene. Abbiamo eseguito uno screening genetico in 300 pazienti sottoposti a trapianto di rene o affetti da malattia renale cronica/ ESRd da causa sconosciuta, al fine di identificare la causa primaria della malattia e discriminare tra potenziali fenotipi sovrapposti. Abbiamo utilizzato un pannello personalizzato per il sequenziamento di DNA attraverso Next Generation Sequencing (tecnologia Agilent, Santa Clara, CA, USA), che includeva il gene GLA associato alla malattia di Fabry, geni che causano sindrome nefrosica e podocitopatie, geni del complemento e geni associati a collagenopatie e sindrome di Alport. Abbiamo individuato varianti patogeniche nei geni associati alla sindrome nefrosica, sindrome di Alport ed alla glomerulosclerosi focale segmentale (FSGS) in 29 pazienti su 300, risolvendo circa il 10% dei probandi. È interessante notare che abbiamo anche trovato una paziente portatrice di una nuova variante missense, c.1259C>A (p.Thr420Lys), nel gene GLA non precedentemente associato alla malattia di Fabry, che è in silico definita come probabilmente patogena e destabilizzante e associata a una lieve alterazione dell’attività enzimatica del GLA. Grazie ad una collaborazione internazionale abbiamo identificato in una coorte di pazienti affetti da podocitopatie, la presenza di anticorpi anti NPHS1, chiarendo alcuni aspetti non noti della fisiopatologia della sindrome nefrosica. L'identificazione del background genetico specifico può fornire l'opportunità di valutare il rischio di recidiva della malattia primaria, soprattutto tra i pazienti candidati che vivono con un trapianto di rene da donatore.

Between 15–20% of patients with end stage renal disease (ESRD) do not know the cause of the primary kidney disease and can develop complications after kidney transplantation. We performed a genetic screening in 300 patients with kidney transplantation, or undiagnosed primary renal disease, in order to identify the primary disease cause and discriminate between overlapping phenotypes. We used a custom-made panel for next-generation sequencing (Agilent technology, Santa Clara, CA, USA), including genes associated with Fabry disease, podocytopaties, complementmediated nephropathies and Alport syndrome-related diseases. We detected candidate diagnostic variants in genes associated with nephrotic syndrome, collagen genes and Focal Segmental Glomerulosclerosis (FSGS) in 29 out of 300 patients, solving about 10% of the probands. Interestingly we also found one female patient carrying a novel missense variant, c.1259C>A (p.Thr420Lys), in the GLA gene not previously associated with Fabry disease, which is in silico defined as a likely pathogenic and destabilizing, and associated with a mild alteration in GLA enzymatic activity. Thanks to a collaborative international collaboration we also identified anti-NPHS1 antibody in a cohort of patients affected by podocytopathies, clarifying important new insight. The identification of the specific genetic background may provide an opportunity to evaluate the risk of recurrence of the primary disease, especially among patient candidates living with a donor kidney transplant.