Analisi del grado di sintenia e colinearità negli afidi: primi dati dall'afide Aphis glycines (Hemiptera, Aphididae)

Recentemente sono stati pubblicati diversi genomi di insetti, ma la maggior parte di essi non dispone di informazioni riguardanti la mappatura degli scaffold identificati, rendendo impossibile valutare sia la presenza di riarrangiamenti cromosomici sia la possibile sintenia tra i diversi taxa. I dati riguardanti la localizzazione cromosomica dei geni annotati potrebbero essere, ad esempio, estremamente rilevanti per la comprensione dell'evoluzione dei cromosomi sessuali e del sistema di determinazione del sesso, un tema di grande interesse per gli insetti parassiti delle coltivazioni. Nel presente progetto di tesi ho mappato 30 Mb del genoma di Aphis glycines (il cui sequenziamento del genoma ਠstato recentemente completato) e confrontato la localizzazione dei geni annotati con le mappe genetiche di Drosophila melanogaster identificando loci ortologhi che coprono tutti e quattro i cromosomi di A. glycines. A. glycines ਠla prima specie di afide ad avere il suo genoma, almeno parzialmente, mappato. L'identificazione di diversi marcatori specifici per i cromosomi migliorerà  la possibilità  di spiegare le diverse proprietà  fisiologiche dei biotipi di A. glycines che rappresentano attualmente una grande fonte di danni per le colture di soia negli Stati Uniti. Infatti, A. glycines, come usuale negli afidi, possiede cromosomi olocentrici che non dispongono della costrizione primaria e non possono essere studiati ricorrendo alle tecniche citogenetiche tradizionali, cosଠche l'identificazione dei marcatori cromosomici ਠessenziale per la corretta indagine dei riarrangiamenti cromosomici sul fenotipo dell'afide.