Diversi casi di leucemia linfoblastica acuta delle cellule T (T-ALL), una delle neoplasie associate a cellule T, nascono da timociti immaturi corrispondenti alle fasi iniziali di maturazione. Diversi sottotipi di T-ALL mostrano traslocazioni cromosomiche che coinvolgono gli elementi del promotore dei geni che codificano i recettori delle cellule T e fattori di trascrizione potenzialmente importanti nel processo di oncogenesi. Più recentemente, la deregolazione di microRNA, geni e fattori di trascrizione associati al normale processo di maturazione delle cellule T è stata indicata come ulteriore meccanismo coinvolto nella patogenesi delle cellule T. Per comprendere il ruolo dei microRNA nella regolazione dello sviluppo normale delle cellule T e nella patogenesi, sono state effettuate un'analisi bioinformatica su un dataset di timociti normali e una meta-analisi su una dataset di T-ALL. Nei timociti normali, è stata osservata una tendenza generale di up-regolazione dei microRNA nei timociti Singolo-Positivi (SP) rispetto ai Doppio-Positivi (DP), ad indicare che l'up-regolazione di questi microRNA potrebbe causare la down-regolazione dei geni associati a un fenotipo immaturo. Diversi microRNA differenzialmente regolati tra SP e DP sono risultati essere coinvolti nel differenziamento cellulare, nella sopravvivenza cellulare e nell'apoptosi. La meta-analisi sul dataset di T-ALL ha identificato diversi fattori di trascrizione up-regolati in T-ALL rispetto ai timociti normali. Tra questi, abbiamo trovato alcuni fattori di trascrizione up-regolati indipendentemente dal sottotipo di T-ALL che potrebbero interagire con fattori di trascrizione specifici di sotto-tipi per causare leucemogenesi delle cellule T. Tre microRNA sono down-regolati sia nel fenotipo immaturo DP e in T-ALL: hsa-miR-22, hsa-miR-26a e hsa-miR-132. Questi microRNA potrebbero avere un ruolo nella regolazione di geni e fattori di trascrizione connessi con fenotipo immaturo di cellule T normali e nella leucemogenesi. È interessante notare che hsa-miR-22 è stato predetto avere come target ETS2, un fattore di trascrizione up-regolato e coinvolto nella maturazione dei timociti. In sintesi, l'analisi bioinformatica suggerisce che microRNA, geni e fattori di trascrizione coinvolti nello sviluppo e nella fisiologia delle cellule T normali possano essere deregolati nel processo di trasformazione neoplastica e contribuire all'insorgenza di T-ALL.
Role of microRNAs in the regulation of normal T cell development and pathogenesis
MUKHERJEE, SUBHAMOY
2013
Abstract
Diversi casi di leucemia linfoblastica acuta delle cellule T (T-ALL), una delle neoplasie associate a cellule T, nascono da timociti immaturi corrispondenti alle fasi iniziali di maturazione. Diversi sottotipi di T-ALL mostrano traslocazioni cromosomiche che coinvolgono gli elementi del promotore dei geni che codificano i recettori delle cellule T e fattori di trascrizione potenzialmente importanti nel processo di oncogenesi. Più recentemente, la deregolazione di microRNA, geni e fattori di trascrizione associati al normale processo di maturazione delle cellule T è stata indicata come ulteriore meccanismo coinvolto nella patogenesi delle cellule T. Per comprendere il ruolo dei microRNA nella regolazione dello sviluppo normale delle cellule T e nella patogenesi, sono state effettuate un'analisi bioinformatica su un dataset di timociti normali e una meta-analisi su una dataset di T-ALL. Nei timociti normali, è stata osservata una tendenza generale di up-regolazione dei microRNA nei timociti Singolo-Positivi (SP) rispetto ai Doppio-Positivi (DP), ad indicare che l'up-regolazione di questi microRNA potrebbe causare la down-regolazione dei geni associati a un fenotipo immaturo. Diversi microRNA differenzialmente regolati tra SP e DP sono risultati essere coinvolti nel differenziamento cellulare, nella sopravvivenza cellulare e nell'apoptosi. La meta-analisi sul dataset di T-ALL ha identificato diversi fattori di trascrizione up-regolati in T-ALL rispetto ai timociti normali. Tra questi, abbiamo trovato alcuni fattori di trascrizione up-regolati indipendentemente dal sottotipo di T-ALL che potrebbero interagire con fattori di trascrizione specifici di sotto-tipi per causare leucemogenesi delle cellule T. Tre microRNA sono down-regolati sia nel fenotipo immaturo DP e in T-ALL: hsa-miR-22, hsa-miR-26a e hsa-miR-132. Questi microRNA potrebbero avere un ruolo nella regolazione di geni e fattori di trascrizione connessi con fenotipo immaturo di cellule T normali e nella leucemogenesi. È interessante notare che hsa-miR-22 è stato predetto avere come target ETS2, un fattore di trascrizione up-regolato e coinvolto nella maturazione dei timociti. In sintesi, l'analisi bioinformatica suggerisce che microRNA, geni e fattori di trascrizione coinvolti nello sviluppo e nella fisiologia delle cellule T normali possano essere deregolati nel processo di trasformazione neoplastica e contribuire all'insorgenza di T-ALL.File | Dimensione | Formato | |
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URN:NBN:IT:UNIPD-81035