Structural analysis of molecular recognition and ligand association processes

Il riconoscimento molecolare è uno step fondamentale nei processi biochimici. Una conoscenza strutturale dettagliata è cruciale per capire meglio i processi in cui sono coinvolti due partner molecolari interagenti e può essere sfruttata in vari campi come il disegno di nuovi assemblamenti sopramolecolari, il disegno razionale di farmaci e l’ingegnerizzazione di enzimi. In questo contesto, ho investigato (prevalentemente tramite cristallografia a raggi x su cristallo singolo) alcuni sistemi proteina-proteina e proteina-ligando per ottenere dettagli strutturali delle interazioni coinvolte, a livello atomico. In primis, il dominio STAS di prestina, una proteina motrice anionidipendente, e la sua interazione con anioni monovalenti e con calmodulina. Poi, l’interazione tra protein chinasi (CDK2 e CK2) e BCL-XL, e inibitori, per il disegno razionale di farmaci specifici nel colpire queste proteine coinvolte in vari tipi di cancro.